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湖南省儿童医院药学部成立于1987年，三十年栉风沐雨，人才机制逐步健全，硬件设施日趋完善。药学部下设：中西药库、门诊药房、中药房、中心药房、急诊药房、临床药学研究室、临床药学咨询室、遗传药理学研究室、药理学教研室、静脉药物配置中心。承担了全院的药品供应、处方调配、合理用药指导与监督、参与临床查房、监测药物不良反应，负责自制制剂的生产和质量控制以及住院病房大部分静脉用药的调配工作。目前，在保证药品供应、调配服务质量的前提下，实行专科药师查房模式，专科临床药师会诊制度，大力发展临床药师培训、国际学员带教及临床药师出国研修、开设药学门诊等。临床药学实验室坚持以“个体化医学”为核心，负责甲氨蝶呤等12种药品的TDM及约50种药物的个体化用药基因检测。
伴随着医院的发展，药学部人才梯队日趋成熟，人员共计76人，其中主任药师4人，副主任药师13人，临床药师17人，主管药师29人，药师17人，博士研究生2人，硕士研究生19人；
目前所取得的学术科研成果成绩可喜。在药学部学术带头人、现任主任赵昕指导带领下，药学部共获省级课题4项，厅局级课题21项；同时获得院内课题3项，近5年共发表SCI文章5篇及各种论文100余篇。
湖南省儿童医院药学部作为湖南省药学会医院药学专业委员会秘书单位，为全省临床用药管理及推动儿科临床合理用药起到了重要的作用，被评为2008-2012年度湖南省药学会先进单位的光荣称号。药学部也多次获得医院先进集体，质量管理明星科室，先进基层党组织等荣誉。
药师在行动，学亦无所息。为顺应时代发展，响应医药改革号召，药学部将秉承“不忘初心，药师在行动”的科训，循着前辈努力的足迹，怀揣为患儿服务的决心，勇于探索，笃定前行。
1985年开始筹建，1987年正式成立。建院之初，为满足我院患儿用药需求，在药学部首任主任刘易飞的带领、杨寿松院长的支持下，制剂室研发数十种自制制剂，其中“鹿珠合剂”由我院原院长杨寿松主导开发，用于儿童祛铅的专利产品。2001年按GMP标准投资500万元左右（含设备）新建装修，当年11月通过验收投入生产，2015年进行局部改造及设备更新。目前，我院制剂室有注册制剂品种28种，制剂年产值600万元。1995年，通过三甲测评。1993年、1995年皆设有一名专职药师负责临床药物咨询，行政查房，抗菌药物统计及不良反应上报等工作。2001年我院引进医院门诊信息管理HIS系统结束了长达13年的手工划价时代，为处方的电子化管理和无纸化办公奠定了基础。同年，临床药学咨询室正式成立，住院部开始前置审方。目前设有6名临床药师，服务覆盖30个临床科室。2018年度临床药师覆盖床位数量为1800床，2017年度发现和纠正审方差错1867例次。2010年，随着急救大楼落成，急诊药房从门诊迁至急救楼东北角。为满足临床需求，提高护理质量，2012年6月，省内唯一一家24H运营的静脉用药调配中心开科，总建筑面积800m2，配备11台生物安全柜，10台垂直层流洁净台，3台药品智能存储柜。2013年JCI评审，静配深受好评。同年筹建GCP，2014年10月20日，国家食品药品监督管理总局发布2014年第48号公告药物临床试验机构资格认定公告（第6号），我院药物临床试验机构经资料审查和现场检查，认定湖南省儿童医院具有药物临床试验资格，发给《药物临床试验机构资格认定证书》。认定专业为：儿童保健科、耳鼻咽喉、小儿神经病学、小儿心脏病、小儿血液病、小儿肾病，证书编号：566。2016年，创立公众号“儿科药师”，进行药学科普推文。2017年，门诊中药房引进中药免煎配方颗粒及中药智能配方机并投入使用。2018年，和医务部牵头，每月一课的“星元学院”拉开帷幕，至今举办20余期。2019年，首次承办“国家卫健委儿童合理用药巡讲”、主办“儿科PIVAS技术与管理培训班”，取得较好反响。是年，临床药学实验室通过液质联用开展“氨基酸和酰基肉碱串联质谱分析”。
从蹒跚学步，到亦步亦趋，再到稳步向前，无一不凝聚了前辈的艰辛付出。时代浪潮下，我院药学部经历了分分合合，2006年重回怀抱的制剂室也于2019年停产，全权委托湖南新汇制药股份有限公司代为生产；2017年，GCP成为医院独立机构。药学部的工作始终与医院的发展战略保持一致， 以院训“精睿博诚”为基础，坚持秉承 “团结进取、创新向上、超越自我”的医院精神，以人为本，逐步形成以服务临床的药学工作为中心，人才队伍建设为先导，教学、科研相结合的学科特色，推动学科建设的发展。转型在即，既是机遇，也是挑战，科室资源将更多地倾注于临床药学，与此同时，储备审方药师，引进前置审方系统，从源头降低不合理处方率。
一、 临床药学研究室
1、 实验室配备有基因测序仪、全自动免疫分析仪、高效液相色谱仪等仪器。
2、 开展了抗癫痫药、免疫抑制剂、抗癌药、抗菌药物等十几种药物血药浓度检测，每年血检测量约6000例。
3、 同时开展了约50种药物的个体化用药基因检测，为指导临床合理用药、减少药物不良反应的发生起到了至关重要的作用。
二、 临床药学咨询室
1、 配备专科临床药师19名，包括重症医学科、新生儿科、新生儿外科、血液肿瘤科、神经内科、神经外科、眼科、心胸外科、骨科、普外科、呼吸内科、肝胆脾胰移植外科、泌尿外科、肾移植外科。
2、 与临床合作愈发密切，负责临床会诊、查房与用药咨询、抗菌药物监测、处方点评、不良反应监测与上报、住院病房电子处方审核、药品督查以及每周病历督查和每月病历质量控制；
3、 开设免费儿童药学门诊，为来院就诊患儿提供专业用药指导，确保用药安全和医疗质量及效果。
4、 药学创新服务及质量提升在全省多次获奖。
三、 静脉用药调配中心（PIVAS）
1、 截至目前全国规模最大最先进的静脉药物调配中心之一。筹建于2011年，使用面积约800平方米，2022年11月重建。
2、 目前拥有3台药品智能存储柜， 9台生物安全柜，6台层流工作台。按照标准操作程序进行全静脉营养、细胞毒性药物和抗生素等静脉药物的混合调配。
3、 负责康复科、感染科、新生儿之外所有临床科室24小时静脉用药调配，让护士回归临床。
全自动免疫分析仪、PyroMark Q24焦磷酸测序仪、高效液相质谱仪、高效液相色谱仪、生物安全柜、水平层流台、药品智能存储柜，智能针剂调配机
